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回文序列和发卡结构

回文序列和发卡结构相信很多小伙伴还不知道,现在让我们一起来看看吧!

1、(1)看引物序列里有无回文序列。

2、(2)不是的,引物二聚体的产生原因比较多,其中很重要的一个就是引物自身的原因,也就是设计的引物特异性不好,不能有效的和模板进行结合,而出现引物自身配对结合的情况导致二聚提的出现;其次还可能是PCR体系及反应条件的问题,如果PCR体系中引物、镁离子以及酶浓度过高等,都容易产生二聚体,这时要适当降低浓度,比如20uLPCR体系中,一般10pmol/ul的引物,加0.2ul就可以了;还有可能是退火温度的问题,可以做个梯度PCR或降落PCR,来摸索一个合适的退火温度,也可有效地减少二聚提的出现。

3、引物设计可以使用Primer Premier 5.0,操作比较简便,同时它可以自动分析引物是否有发夹结构、引物二聚体等,非常方便。

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